Mikrobiologie životního prostředí
Studujeme složení, rozmanitost a funkci mikrobiálních společenstev s cílem objasnit jejich schopnost adaptovat se na změny v prostředí, které jsou často způsobené lidskými aktivitami. Aktuálně řešíme otázky kolem odpovědi půdních mikroorganizmů na přídavky produktů čistíren odpadních vod a léčiv, které jsou v těchto produktech obsaženy. Zaměřujeme se také na biologii, ekofyziologii a genomiku aktinomycet (vláknitých aktinobakterií) a to zejména na produkci sekundárních metabolitů a hydrolytických enzymů. Jejich adaptační mechanizmy jim umožňují obsadit specifické niky a vytvářet úzké vztahy s jinými organizmy: bezobratlí, hmyz, rostliny či člověk.
Zabýváme se izolací, identifikací a uchováváním kultur aktinomycet ve Sbírce kultur aktinomycet v rámci BCCO.