Anaerobní a molekulární mikrobiologie
O laboratoři
Laboratoř anaerobní a molekulární mikrobiologie v UPBB se specializuje na práci s anoxickými environmentálními vzorky a anaerobními mikroorganismy.
Přístroje
Laboratoř je dobře vybavena různými přístroji pro:
Anaerobní práci:
- Vinylová anaerobní komora (COY),
- anaerobní plynový rozvod.
Extrakci DNA/RNA:
- FastPrep-24™ 5G,
- Centrifuga 5430R (Eppendorf),
- c300 Chemi Blue light White light UV (Azure Biosystems)
Molekulární analýzu:
- NanoDrop™ 2000, Qubit 2.0, Synergy™ 2 Multi-Mode Microplate Reader, 2100 Bioanalyzer.
Analýzu dat:
- Výkonný počítačový server s 48 jádry a 512GB RAM.
Kvantifikaci genů a transkriptů:
- QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR System,
- T100 Thermal cycler,
- StepOnePlus Real-Time PCR.
Stabilní izotopové značení:
- Ultracentrifuga Sorvall WX Ultra 100,
- refraktometr AR200.
Služby
Laboratoř nabízí:
- Zpracování vzorků a inkubaci za anoxických podmínek.
- Kultivaci mikroorganismů za anoxických podmínek.
- Extrakci DNA a RNA z různých environmentálních vzorků.
- Analýzu mikrobiomu pomocí metagenomiky.
- Kvantifikaci environmentálních genů a transkriptů.
- Stabilní izotopové značení DNA, RNA a PLFA.
Lidé
Klíčový personál zahrnuje:
- Dr. Roey Angel: Vedoucí laboratoře.
- RNDr. Eva Petrová: Výzkumná asistentka.
Projekty
- Jako ryba na suchu? Objasnění ekofyziologie metanogenů z povrchových půd pomocí kultivace a omických metod (GA ČR projekt č. 22-34650S, 2022- )
- S malou pomocí mých přátel: pochopení role a důležitosti střevního mikrobiomu mnohonožek (GA ČR projekt č. 19-24309Y, 2019-2021)
- Alternativní cesty přenosu energie – zaostřeno na planktonní potravní sítě mělkých jezer (GA ČR projekt č. 19-24309Y, 2019-2021)
- Funkční a transkriptomická analýza trávení listového opadu mnohonožkami: Role mikroorganismů a trávicích enzymů. (GA ČR projekt č. 17-22572S, 2017-2019)
- Open Science : Teatime4Schools (2018-2019)
- Evrona Nature Reserve Oil Contamination Ecological Monitoring Program (Israel, 2018-2022)
- Mikroorganismy z vrcholků hor: jak mikroorganismy rhizosféry pomáhají rostlinám vypořádat se s rychle měnícím klimatem vysokohorských pouští Himaláje. (GA ČR projekt č. 1-04987S, 2021-2024)
Kontaktní informace
Vedoucí laboratoře:
Dr. Roey Angel,
roey.angel@bc.cas.cz,
+420 387 775 847
Manažerka laboratoře:
RNDr. Eva Petrová,
eva.petrova@bc.cas.cz,
+420 387 775 847.
Pokud potřebujete nějaké podrobnější informace, dejte nám vědět!
