Plazmidy zajišťující odolnost k antibiotikům jsou hojné v kravském hnoji a hnojené půdě
Plazmidy jsou malé kruhové molekuly DNA vyskytující se u bakterií. Nesou přídatnou genetickou informaci, která není nezbytná pro růst bakterie, ale může jí umožnit přežití ve ztížených podmínkách, např. když se musí bránit proti antibiotikům. Plazmidy tak často nesou geny pro odolnost k antibiotikům a v tom spočívá jejich hrozba pro lidstvo, jelikož se dramaticky snižuje účinnost léčby infekčních nemocí pomocí antibiotických léčiv. Pomocí plazmidů si totiž mohou různé nepříbuzné bakterie předávat tyto geny rezistence. Odolnost k antibiotikům se tak může šířit mezi bakteriemi v životním prostředí, ale i v lidském těle, kam mohou bakterie docestovat potravním řetězcem.
Nová varianta bakteriálního plazmidu, tzv. LowGC-typu, nesoucí geny odolnosti k antibiotikům tetracyklinu a streptomycinu byla objevena v exkrementech mléčného skotu z České republiky. Pomocí nejmodernější metody sekvenování nové generace přečetli vědci z Oddělení půdní mikrobiologie BC AV ČR celou genetickou informaci plazmidu. Analýzy DNA ve vzorcích exkrementů, hnoje a půdy ze studované mléčné farmy ukázaly, že tento typ plazmidu je hojný především v hnoji a v půdě, do které se hnůj dostává, a že se tak může podílet na šíření bakteriální rezistence k antibiotikům.
Další genetické analýzy naznačily, že může docházet k výměně genetické informace mezi LowGC plazmidy a bakteriemi rodu Acinetobacter, které byly též izolovány z exkrementů mléčného skotu, a které jsou považovány za přirozené hostitele plazmidů LowGC typu. Některé druhy bakterií z rodu Acinetobacter mohou způsobovat závažná onemocnění u hospitalizovaných pacientů a LowGC plazmidy se tak dostávají na seznam plazmidů podezřelých z přenosu odolnosti k antibiotikům mezi bakteriemi z prostředí a lidskými patogeny.
Citace:
Kyselková M, Chrudimský T, Husník F, Chroňáková A, Heuer H, Smalla K, Elhottová D. Characterization of tet(Y)-carrying LowGC plasmids exogenously captured from cow manure at a conventional dairy farm. FEMS Microbiol Ecol. 2016 Jun;92(6). pii: fiw075. doi: 10.1093/femsec/fiw075. Epub 2016 Apr 15.
